RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474416.1

TMEM184B-209, Transcript of transmembrane protein 184B, human

TSL 2

Gene TMEM184B, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM184B-209	ENST00000474416	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.49	■■■■■ 6.63
TMEM184B-209	ENST00000474416	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.46	■■■■■ 5.67
TMEM184B-209	ENST00000474416	ABCC9	O60706	1549 aa		50.15	■■■■■ 5.62
TMEM184B-209	ENST00000474416	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.83	■■■■■ 5.25
TMEM184B-209	ENST00000474416	NACAD	O15069	1562 aa		47.62	■■■■■ 5.21
TMEM184B-209	ENST00000474416	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.42	■■■■■ 5.18
TMEM184B-209	ENST00000474416	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		47.1	■■■■■ 5.13
TMEM184B-209	ENST00000474416	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	46.93	■■■■■ 5.1
TMEM184B-209	ENST00000474416	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.82	■■■■■ 5.09
TMEM184B-209	ENST00000474416	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.77	■■■■■ 5.08
TMEM184B-209	ENST00000474416	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.77	■■■■■ 5.08
TMEM184B-209	ENST00000474416	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.66	■■■■■ 5.06
TMEM184B-209	ENST00000474416	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.54	■■■■■ 5.04
TMEM184B-209	ENST00000474416	SCRIB	Q14160	1630 aa		46.07	■■■■■ 4.97
TMEM184B-209	ENST00000474416	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.83	■■■■■ 4.93
TMEM184B-209	ENST00000474416	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	45.32	■■■■■ 4.85
TMEM184B-209	ENST00000474416	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		45.31	■■■■■ 4.84
TMEM184B-209	ENST00000474416	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		45.1	■■■■■ 4.81
TMEM184B-209	ENST00000474416	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.99	■■■■■ 4.63
TMEM184B-209	ENST00000474416	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.98	■■■■■ 4.63
TMEM184B-209	ENST00000474416	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.95	■■■■■ 4.63
TMEM184B-209	ENST00000474416	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.78	■■■■■ 4.6
TMEM184B-209	ENST00000474416	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.76	■■■■■ 4.6
TMEM184B-209	ENST00000474416	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.69	■■■■■ 4.59
TMEM184B-209	ENST00000474416	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.57	■■■■■ 4.57
TMEM184B-209	ENST00000474416	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.55	■■■■■ 4.56
TMEM184B-209	ENST00000474416	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.49	■■■■■ 4.55
TMEM184B-209	ENST00000474416	NES	P48681	1621 aa		43.23	■■■■■ 4.51
TMEM184B-209	ENST00000474416	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.19	■■■■■ 4.51
TMEM184B-209	ENST00000474416	WIZ	O95785	1651 aa		43.05	■■■■■ 4.48
TMEM184B-209	ENST00000474416	CUX2	O14529	1486 aa		43	■■■■■ 4.47
TMEM184B-209	ENST00000474416	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.9	■■■■■ 4.46
TMEM184B-209	ENST00000474416	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	42.8	■■■■■ 4.44
TMEM184B-209	ENST00000474416	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.69	■■■■■ 4.43
TMEM184B-209	ENST00000474416	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.66	■■■■■ 4.42
TMEM184B-209	ENST00000474416	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.63	■■■■■ 4.42
TMEM184B-209	ENST00000474416	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.63	■■■■■ 4.41
TMEM184B-209	ENST00000474416	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		42.54	■■■■■ 4.4
TMEM184B-209	ENST00000474416	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.51	■■■■■ 4.39
TMEM184B-209	ENST00000474416	CFTR	P13569	1480 aa		42.28	■■■■■ 4.36
TMEM184B-209	ENST00000474416	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		42.28	■■■■■ 4.36
TMEM184B-209	ENST00000474416	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		42.19	■■■■■ 4.34
TMEM184B-209	ENST00000474416	WDR62	O43379	1518 aa		42.18	■■■■■ 4.34
TMEM184B-209	ENST00000474416	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		42.17	■■■■■ 4.34
TMEM184B-209	ENST00000474416	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		42.04	■■■■■ 4.32
TMEM184B-209	ENST00000474416	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.86	■■■■■ 4.29
TMEM184B-209	ENST00000474416	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.83	■■■■■ 4.29
TMEM184B-209	ENST00000474416	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.45	■■■■■ 4.23
TMEM184B-209	ENST00000474416	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.31	■■■■■ 4.2
TMEM184B-209	ENST00000474416	IFT140	Q96RY7	1462 aa		41.31	■■■■■ 4.2
TMEM184B-209	ENST00000474416	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	41.29	■■■■■ 4.2
TMEM184B-209	ENST00000474416	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.28	■■■■■ 4.2
TMEM184B-209	ENST00000474416	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	41.14	■■■■■ 4.18
TMEM184B-209	ENST00000474416	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	41.07	■■■■■ 4.16
TMEM184B-209	ENST00000474416	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.06	■■■■■ 4.16
TMEM184B-209	ENST00000474416	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	41.06	■■■■■ 4.16
TMEM184B-209	ENST00000474416	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	41.03	■■■■■ 4.16
TMEM184B-209	ENST00000474416	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.94	■■■■■ 4.14
TMEM184B-209	ENST00000474416	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.93	■■■■■ 4.14
TMEM184B-209	ENST00000474416	CUX1	P39880	1505 aa		40.92	■■■■■ 4.14
TMEM184B-209	ENST00000474416	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.85	■■■■■ 4.13
TMEM184B-209	ENST00000474416	TRIM41	Q8WV44	630 aa		40.84	■■■■■ 4.13
TMEM184B-209	ENST00000474416	SOGA1	O94964	1423 aa		40.84	■■■■■ 4.13
TMEM184B-209	ENST00000474416	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.74	■■■■■ 4.11
TMEM184B-209	ENST00000474416	CHD1	O14646	1710 aa		40.64	■■■■■ 4.1
TMEM184B-209	ENST00000474416	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.59	■■■■■ 4.09
TMEM184B-209	ENST00000474416	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.56	■■■■■ 4.08
TMEM184B-209	ENST00000474416	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.56	■■■■■ 4.08
TMEM184B-209	ENST00000474416	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.56	■■■■■ 4.08
TMEM184B-209	ENST00000474416	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.53	■■■■■ 4.08
TMEM184B-209	ENST00000474416	FBLN2	P98095	1184 aa		40.5	■■■■■ 4.07
TMEM184B-209	ENST00000474416	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.49	■■■■■ 4.07
TMEM184B-209	ENST00000474416	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.43	■■■■■ 4.06
TMEM184B-209	ENST00000474416	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.41	■■■■■ 4.06
TMEM184B-209	ENST00000474416	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.39	■■■■■ 4.06
TMEM184B-209	ENST00000474416	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.36	■■■■■ 4.05
TMEM184B-209	ENST00000474416	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.33	■■■■■ 4.05
TMEM184B-209	ENST00000474416	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	40.33	■■■■■ 4.05
TMEM184B-209	ENST00000474416	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.32	■■■■■ 4.05
TMEM184B-209	ENST00000474416	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.31	■■■■■ 4.04
TMEM184B-209	ENST00000474416	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.31	■■■■■ 4.04
TMEM184B-209	ENST00000474416	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.31	■■■■■ 4.04
TMEM184B-209	ENST00000474416	SYNJ2	O15056	1496 aa		40.26	■■■■■ 4.04
TMEM184B-209	ENST00000474416	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	40.26	■■■■■ 4.04
TMEM184B-209	ENST00000474416	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		40.23	■■■■■ 4.03
TMEM184B-209	ENST00000474416	ARAP1	Q96P48	1450 aa		40.16	■■■■■ 4.02
TMEM184B-209	ENST00000474416	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		40.12	■■■■■ 4.01
TMEM184B-209	ENST00000474416	ADAMTS12	P58397	1594 aa		39.99	■■■■□ 3.99
TMEM184B-209	ENST00000474416	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.94	■■■■□ 3.98
TMEM184B-209	ENST00000474416	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		39.87	■■■■□ 3.97
TMEM184B-209	ENST00000474416	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.85	■■■■□ 3.97
TMEM184B-209	ENST00000474416	NUP160	Q12769	1436 aa		39.82	■■■■□ 3.96
TMEM184B-209	ENST00000474416	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.81	■■■■□ 3.96
TMEM184B-209	ENST00000474416	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.68	■■■■□ 3.94
TMEM184B-209	ENST00000474416	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.58	■■■■□ 3.93
TMEM184B-209	ENST00000474416	IGF1R	P08069	1367 aa		39.5	■■■■□ 3.91
TMEM184B-209	ENST00000474416	KIF27	Q86VH2	1401 aa		39.49	■■■■□ 3.91
TMEM184B-209	ENST00000474416	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	39.49	■■■■□ 3.91
TMEM184B-209	ENST00000474416	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		39.42	■■■■□ 3.9
TMEM184B-209	ENST00000474416	JPH4	Q96JJ6	628 aa		39.36	■■■■□ 3.89

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms