Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RAB35Q15286 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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RAB35Q15286 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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RAB35Q15286 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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RAB35Q15286 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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RAB35Q15286 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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RAB35Q15286 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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RAB35Q15286 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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RAB35Q15286 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB35Q15286 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB35Q15286 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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