Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRJQ12913 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRJQ12913 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRJQ12913 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRJQ12913 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRJQ12913 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPRJQ12913 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRJQ12913 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRJQ12913 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRJQ12913 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTPRJQ12913 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRJQ12913 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRJQ12913 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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