Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 IOC4YMR044W 1428 nt4.6□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 CLF1YLR117C 2064 nt4.6□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 LHP1YDL051W 828 nt4.59□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 KEX1YGL203C 2190 nt4.59□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 ERD2YBL040C 660 nt4.59□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 SPS19YNL202W 879 nt4.59□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 snR17bsnR17b 332 nt4.59□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 CLB5YPR120C 1308 nt4.59□□□□□ -1.67
NMD4Q12129 PDR15YDR406W 4590 nt4.59□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 SBE2YDR351W 2595 nt4.59□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 AXL2YIL140W 2472 nt4.58□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 YND1YER005W 1893 nt4.58□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 YAP1802YGR241C 1707 nt4.58□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 SIF2YBR103W 1608 nt4.58□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 YDR222WYDR222W 1248 nt4.58□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 DAM1YGR113W 1032 nt4.58□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt4.58□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 WSS1YHR134W 810 nt4.58□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 YKL177WYKL177W 339 nt4.58□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 MED7YOL135C 669 nt4.58□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 GRE1YPL223C 507 nt4.58□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 CDC28YBR160W 897 nt4.58□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 MRPL37YBR268W 318 nt4.58□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 MSC7YHR039C 1935 nt4.58□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 TOS3YGL179C 1683 nt4.57□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 PUT1YLR142W 1431 nt4.57□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 FMP30YPL103C 1407 nt4.57□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 PRO2YOR323C 1371 nt4.57□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 ADH4YGL256W 1149 nt4.57□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt4.57□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt4.57□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 BMT5YIL096C 1011 nt4.57□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.57□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 YAR061WYAR061W 204 nt4.57□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 CDC73YLR418C 1182 nt4.57□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 RTK1YDL025C 1863 nt4.57□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 BOI2YER114C 3123 nt4.57□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 ARX1YDR101C 1782 nt4.57□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 NUP116YMR047C 3342 nt4.57□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 RRP3YHR065C 1506 nt4.56□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 BBC1YJL020C 3474 nt4.56□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 SAC1YKL212W 1872 nt4.56□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 TFC7YOR110W 1308 nt4.56□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 MSS2YDL107W 1056 nt4.56□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 KIN28YDL108W 921 nt4.56□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 YER084WYER084W 387 nt4.56□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 NPY1YGL067W 1155 nt4.56□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 ECT1YGR007W 972 nt4.56□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 POP6YGR030C 477 nt4.56□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 NAT2YGR147C 867 nt4.56□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 YGR153WYGR153W 654 nt4.56□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 RPC17YJL011C 486 nt4.56□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 YBL036CYBL036C 774 nt4.56□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 TGS1YPL157W 948 nt4.56□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 YGR125WYGR125W 3111 nt4.56□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 NOP8YOL144W 1455 nt4.56□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 KRE6YPR159W 2163 nt4.55□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 PUF2YPR042C 3228 nt4.55□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 NSE1YLR007W 1011 nt4.55□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 URE2YNL229C 1065 nt4.55□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 MRP21YBL090W 534 nt4.55□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 FAA3YIL009W 2085 nt4.55□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 NAM9YNL137C 1461 nt4.55□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 KAR2YJL034W 2049 nt4.55□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 SPO1YNL012W 1896 nt4.54□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 ORC6YHR118C 1308 nt4.54□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 YFT2YDR319C 825 nt4.54□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 YHB1YGR234W 1200 nt4.54□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 LSM12YHR121W 564 nt4.54□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 APS1YLR170C 471 nt4.54□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 GCD7YLR291C 1146 nt4.54□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 RNA1YMR235C 1224 nt4.54□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 ATG8YBL078C 354 nt4.54□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 MAK3YPR051W 531 nt4.54□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 CLN2YPL256C 1638 nt4.54□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 YCR101CYCR101C 549 nt4.53□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 HIS6YIL020C 786 nt4.53□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 DID4YKL002W 699 nt4.53□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 YKL023WYKL023W 834 nt4.53□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 RFU1YLR073C 603 nt4.53□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 WRS1YOL097C 1299 nt4.53□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 MFM1YPL060W 1242 nt4.53□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.53□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.53□□□□□ -1.68
NMD4Q12129 PRP19YLL036C 1512 nt4.52□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 PAN1YIR006C 4443 nt4.52□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 RCM1YNL022C 1473 nt4.52□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 AVT1YJR001W 1809 nt4.52□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 RPC53YDL150W 1269 nt4.52□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 JAC1YGL018C 555 nt4.52□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 RMR1YGL250W 726 nt4.52□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YGR269WYGR269W 327 nt4.52□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 MIM2YLR099W-A 264 nt4.52□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 NIT3YLR351C 876 nt4.52□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 HLJ1YMR161W 675 nt4.52□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 MAP2YBL091C 1266 nt4.52□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 FEX1YOR390W 1128 nt4.52□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 FEX2YPL279C 1128 nt4.52□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 CDC48YDL126C 2508 nt4.52□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 SEG2YKL105C 3399 nt4.52□□□□□ -1.69
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