Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIK1P57059 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIK1P57059 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIK1P57059 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIK1P57059 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIK1P57059 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIK1P57059 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIK1P57059 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIK1P57059 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIK1P57059 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIK1P57059 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SIK1P57059 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIK1P57059 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIK1P57059 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIK1P57059 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIK1P57059 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIK1P57059 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIK1P57059 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SIK1P57059 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SIK1P57059 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIK1P57059 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIK1P57059 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIK1P57059 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIK1P57059 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIK1P57059 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIK1P57059 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIK1P57059 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIK1P57059 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIK1P57059 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIK1P57059 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIK1P57059 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SIK1P57059 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIK1P57059 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIK1P57059 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIK1P57059 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SIK1P57059 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SIK1P57059 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIK1P57059 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIK1P57059 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIK1P57059 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIK1P57059 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIK1P57059 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIK1P57059 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIK1P57059 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIK1P57059 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIK1P57059 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIK1P57059 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIK1P57059 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SIK1P57059 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIK1P57059 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIK1P57059 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIK1P57059 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIK1P57059 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIK1P57059 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIK1P57059 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIK1P57059 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIK1P57059 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIK1P57059 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIK1P57059 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIK1P57059 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIK1P57059 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIK1P57059 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIK1P57059 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIK1P57059 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SIK1P57059 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIK1P57059 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIK1P57059 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SIK1P57059 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIK1P57059 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIK1P57059 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIK1P57059 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SIK1P57059 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIK1P57059 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIK1P57059 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIK1P57059 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIK1P57059 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIK1P57059 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIK1P57059 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIK1P57059 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIK1P57059 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIK1P57059 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIK1P57059 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIK1P57059 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIK1P57059 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIK1P57059 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SIK1P57059 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIK1P57059 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIK1P57059 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIK1P57059 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIK1P57059 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIK1P57059 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIK1P57059 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIK1P57059 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIK1P57059 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIK1P57059 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIK1P57059 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIK1P57059 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIK1P57059 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIK1P57059 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms