Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRKAA2P54646 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRKAA2P54646 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRKAA2P54646 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms