Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPA3P35244 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPA3P35244 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPA3P35244 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPA3P35244 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPA3P35244 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPA3P35244 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPA3P35244 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPA3P35244 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPA3P35244 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPA3P35244 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPA3P35244 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPA3P35244 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPA3P35244 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPA3P35244 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPA3P35244 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPA3P35244 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA3P35244 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA3P35244 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA3P35244 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA3P35244 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA3P35244 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA3P35244 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA3P35244 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA3P35244 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA3P35244 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA3P35244 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA3P35244 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA3P35244 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPA3P35244 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPA3P35244 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPA3P35244 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPA3P35244 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPA3P35244 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPA3P35244 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPA3P35244 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPA3P35244 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPA3P35244 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPA3P35244 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPA3P35244 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPA3P35244 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPA3P35244 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPA3P35244 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA3P35244 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA3P35244 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA3P35244 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA3P35244 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA3P35244 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA3P35244 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA3P35244 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA3P35244 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPA3P35244 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPA3P35244 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPA3P35244 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPA3P35244 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPA3P35244 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPA3P35244 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPA3P35244 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPA3P35244 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPA3P35244 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPA3P35244 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA3P35244 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA3P35244 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA3P35244 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA3P35244 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA3P35244 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA3P35244 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA3P35244 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA3P35244 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA3P35244 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA3P35244 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA3P35244 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA3P35244 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA3P35244 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPA3P35244 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPA3P35244 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPA3P35244 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPA3P35244 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPA3P35244 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPA3P35244 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RPA3P35244 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPA3P35244 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPA3P35244 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPA3P35244 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPA3P35244 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPA3P35244 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPA3P35244 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPA3P35244 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPA3P35244 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPA3P35244 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPA3P35244 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPA3P35244 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPA3P35244 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA3P35244 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA3P35244 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA3P35244 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA3P35244 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA3P35244 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA3P35244 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPA3P35244 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms