Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP6P35125 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP6P35125 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP6P35125 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP6P35125 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP6P35125 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP6P35125 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP6P35125 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP6P35125 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP6P35125 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP6P35125 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
USP6P35125 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP6P35125 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
USP6P35125 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP6P35125 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP6P35125 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP6P35125 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP6P35125 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP6P35125 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP6P35125 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP6P35125 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP6P35125 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP6P35125 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP6P35125 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
USP6P35125 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP6P35125 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP6P35125 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP6P35125 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP6P35125 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP6P35125 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP6P35125 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP6P35125 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP6P35125 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP6P35125 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP6P35125 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP6P35125 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP6P35125 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP6P35125 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP6P35125 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP6P35125 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
USP6P35125 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP6P35125 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP6P35125 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP6P35125 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP6P35125 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP6P35125 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP6P35125 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP6P35125 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP6P35125 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP6P35125 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP6P35125 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP6P35125 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP6P35125 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP6P35125 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP6P35125 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP6P35125 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP6P35125 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
USP6P35125 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP6P35125 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP6P35125 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP6P35125 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP6P35125 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP6P35125 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
USP6P35125 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP6P35125 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP6P35125 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP6P35125 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP6P35125 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP6P35125 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP6P35125 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP6P35125 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP6P35125 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP6P35125 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP6P35125 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP6P35125 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP6P35125 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP6P35125 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
USP6P35125 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP6P35125 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP6P35125 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP6P35125 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP6P35125 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
USP6P35125 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
USP6P35125 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP6P35125 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP6P35125 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP6P35125 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP6P35125 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP6P35125 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP6P35125 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP6P35125 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP6P35125 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
USP6P35125 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP6P35125 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP6P35125 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP6P35125 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP6P35125 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP6P35125 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP6P35125 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP6P35125 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms