Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HOXD10P28358 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms