Protein–RNA interactions for Protein: P23458

JAK1, Tyrosine-protein kinase JAK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAK1P23458 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAK1P23458 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAK1P23458 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAK1P23458 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAK1P23458 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAK1P23458 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAK1P23458 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAK1P23458 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAK1P23458 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAK1P23458 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAK1P23458 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAK1P23458 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAK1P23458 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAK1P23458 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAK1P23458 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAK1P23458 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JAK1P23458 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
JAK1P23458 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAK1P23458 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAK1P23458 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAK1P23458 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAK1P23458 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAK1P23458 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAK1P23458 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAK1P23458 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAK1P23458 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAK1P23458 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAK1P23458 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAK1P23458 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAK1P23458 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAK1P23458 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAK1P23458 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAK1P23458 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAK1P23458 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAK1P23458 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
JAK1P23458 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
JAK1P23458 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
JAK1P23458 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
JAK1P23458 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
JAK1P23458 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
JAK1P23458 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
JAK1P23458 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
JAK1P23458 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
JAK1P23458 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
JAK1P23458 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
JAK1P23458 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
JAK1P23458 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
JAK1P23458 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
JAK1P23458 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
JAK1P23458 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
JAK1P23458 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
JAK1P23458 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
JAK1P23458 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
JAK1P23458 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
JAK1P23458 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
JAK1P23458 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
JAK1P23458 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
JAK1P23458 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JAK1P23458 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JAK1P23458 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
JAK1P23458 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JAK1P23458 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
JAK1P23458 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JAK1P23458 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JAK1P23458 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
JAK1P23458 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
JAK1P23458 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
JAK1P23458 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
JAK1P23458 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
JAK1P23458 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
JAK1P23458 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
JAK1P23458 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
JAK1P23458 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
JAK1P23458 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
JAK1P23458 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
JAK1P23458 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
JAK1P23458 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
JAK1P23458 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
JAK1P23458 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
JAK1P23458 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
JAK1P23458 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
JAK1P23458 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
JAK1P23458 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
JAK1P23458 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
JAK1P23458 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
JAK1P23458 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
JAK1P23458 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
JAK1P23458 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
JAK1P23458 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
JAK1P23458 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
JAK1P23458 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
JAK1P23458 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
JAK1P23458 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
JAK1P23458 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
JAK1P23458 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
JAK1P23458 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JAK1P23458 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JAK1P23458 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
JAK1P23458 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JAK1P23458 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms