Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BMP3P12645 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BMP3P12645 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BMP3P12645 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BMP3P12645 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BMP3P12645 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BMP3P12645 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BMP3P12645 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BMP3P12645 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BMP3P12645 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BMP3P12645 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BMP3P12645 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BMP3P12645 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BMP3P12645 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BMP3P12645 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BMP3P12645 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BMP3P12645 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BMP3P12645 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BMP3P12645 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BMP3P12645 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BMP3P12645 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BMP3P12645 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BMP3P12645 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BMP3P12645 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BMP3P12645 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BMP3P12645 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BMP3P12645 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BMP3P12645 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BMP3P12645 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BMP3P12645 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BMP3P12645 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BMP3P12645 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BMP3P12645 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BMP3P12645 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BMP3P12645 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BMP3P12645 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BMP3P12645 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BMP3P12645 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BMP3P12645 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BMP3P12645 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BMP3P12645 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BMP3P12645 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BMP3P12645 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BMP3P12645 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BMP3P12645 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BMP3P12645 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BMP3P12645 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BMP3P12645 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BMP3P12645 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BMP3P12645 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BMP3P12645 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BMP3P12645 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BMP3P12645 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BMP3P12645 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BMP3P12645 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BMP3P12645 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BMP3P12645 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BMP3P12645 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BMP3P12645 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BMP3P12645 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BMP3P12645 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BMP3P12645 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BMP3P12645 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BMP3P12645 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BMP3P12645 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BMP3P12645 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BMP3P12645 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BMP3P12645 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BMP3P12645 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BMP3P12645 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BMP3P12645 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BMP3P12645 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BMP3P12645 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BMP3P12645 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BMP3P12645 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BMP3P12645 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BMP3P12645 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BMP3P12645 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BMP3P12645 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BMP3P12645 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BMP3P12645 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BMP3P12645 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BMP3P12645 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BMP3P12645 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BMP3P12645 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BMP3P12645 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BMP3P12645 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BMP3P12645 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BMP3P12645 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BMP3P12645 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BMP3P12645 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BMP3P12645 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BMP3P12645 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BMP3P12645 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BMP3P12645 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BMP3P12645 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BMP3P12645 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BMP3P12645 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BMP3P12645 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BMP3P12645 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms