Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RLBP1P12271 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RLBP1P12271 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RLBP1P12271 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms