Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB1P08034 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB1P08034 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB1P08034 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB1P08034 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB1P08034 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB1P08034 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB1P08034 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB1P08034 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB1P08034 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB1P08034 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB1P08034 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB1P08034 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB1P08034 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB1P08034 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB1P08034 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB1P08034 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB1P08034 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB1P08034 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB1P08034 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB1P08034 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB1P08034 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB1P08034 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB1P08034 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB1P08034 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB1P08034 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB1P08034 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB1P08034 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB1P08034 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB1P08034 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB1P08034 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB1P08034 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB1P08034 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB1P08034 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB1P08034 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB1P08034 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB1P08034 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB1P08034 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB1P08034 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB1P08034 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB1P08034 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB1P08034 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB1P08034 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB1P08034 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB1P08034 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB1P08034 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB1P08034 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB1P08034 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB1P08034 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB1P08034 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB1P08034 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB1P08034 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB1P08034 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB1P08034 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB1P08034 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB1P08034 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB1P08034 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB1P08034 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB1P08034 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB1P08034 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB1P08034 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB1P08034 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB1P08034 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB1P08034 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB1P08034 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB1P08034 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB1P08034 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB1P08034 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB1P08034 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB1P08034 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB1P08034 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB1P08034 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB1P08034 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB1P08034 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB1P08034 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB1P08034 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB1P08034 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB1P08034 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB1P08034 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB1P08034 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB1P08034 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB1P08034 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB1P08034 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB1P08034 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJB1P08034 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJB1P08034 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJB1P08034 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB1P08034 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB1P08034 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB1P08034 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB1P08034 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB1P08034 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB1P08034 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB1P08034 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB1P08034 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB1P08034 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB1P08034 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB1P08034 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB1P08034 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB1P08034 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms