Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF40AO75400 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF40AO75400 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms