Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC7A4O43246 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC7A4O43246 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC7A4O43246 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.4 ms