Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms