Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROB1E7EW31 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PROB1E7EW31 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PROB1E7EW31 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms