Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
ARID3CA6NKF2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARID3CA6NKF2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARID3CA6NKF2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms