Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF804BA4D1E1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZNF804BA4D1E1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms