Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PAXBP1Q9Y5B6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAXBP1Q9Y5B6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms