Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM5BQ9UGL1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
KDM5BQ9UGL1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC35.38■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM5BQ9UGL1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms