Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TVP23BQ9NYZ1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TVP23BQ9NYZ1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.5 ms