Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPRD1BQ9NQG5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPRD1BQ9NQG5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms