Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
STRA6Q9BX79 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
STRA6Q9BX79 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
STRA6Q9BX79 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms