Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUP85Q9BW27 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP85Q9BW27 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP85Q9BW27 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms