Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SH2D3AQ9BRG2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SH2D3AQ9BRG2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2D3AQ9BRG2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203 ms