Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGD4Q96M96 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FGD4Q96M96 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FGD4Q96M96 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms