Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CNBD2Q96M20 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CNBD2Q96M20 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CNBD2Q96M20 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms