Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C8orf48Q96LL4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C8orf48Q96LL4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms