Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUBCNQ92622 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUBCNQ92622 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms