Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD5Q8TDI0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD5Q8TDI0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD5Q8TDI0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD5Q8TDI0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD5Q8TDI0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD5Q8TDI0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD5Q8TDI0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD5Q8TDI0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD5Q8TDI0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD5Q8TDI0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD5Q8TDI0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD5Q8TDI0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD5Q8TDI0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD5Q8TDI0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD5Q8TDI0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD5Q8TDI0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD5Q8TDI0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD5Q8TDI0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHD5Q8TDI0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHD5Q8TDI0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms