Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
PPARGC1BQ86YN6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PPARGC1BQ86YN6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PPARGC1BQ86YN6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms