Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL24

TMED8, Protein TMED8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED8Q6PL24 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMED8Q6PL24 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMED8Q6PL24 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMED8Q6PL24 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMED8Q6PL24 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMED8Q6PL24 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMED8Q6PL24 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMED8Q6PL24 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms