Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LETMD1Q6P1Q0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms