Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6S3

PHF19, PHD finger protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF19Q5T6S3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PHF19Q5T6S3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF19Q5T6S3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms