Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CC2D1BQ5T0F9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CC2D1BQ5T0F9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms