Protein–RNA interactions for Protein: Q1HG43

DUOXA1, Dual oxidase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOXA1Q1HG43 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUOXA1Q1HG43 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DUOXA1Q1HG43 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms