Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKN3Q16667 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDKN3Q16667 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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