Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
EEA1Q15075 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.5
EEA1Q15075 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
EEA1Q15075 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
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