Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF9Q13886 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLF9Q13886 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms