Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 RABGEF1-211ENST00000503687 4139 ntTSL 210.1□□□□□ -0.797e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.87e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.961e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.961e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.961e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.971e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.981e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 RABGEF1-209ENST00000607882 2654 ntTSL 28.87□□□□□ -0.997e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 KLF3-202ENST00000482150 517 ntTSL 28.81□□□□□ -17e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-207ENST00000416707 1260 ntTSL 1 (best)8.6□□□□□ -1.031e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-219ENST00000446860 1565 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.031e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-210ENST00000431721 2174 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.091e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-220ENST00000449563 580 ntTSL 48.17□□□□□ -1.11e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-203ENST00000412795 750 ntTSL 38□□□□□ -1.131e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.141e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-209ENST00000424035 568 ntTSL 47.73□□□□□ -1.171e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-214ENST00000436134 631 ntTSL 37.73□□□□□ -1.171e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-222ENST00000450045 689 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.181e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-224ENST00000454335 631 ntTSL 47.68□□□□□ -1.181e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-206ENST00000413654 553 ntTSL 47.64□□□□□ -1.191e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-213ENST00000434860 560 ntTSL 47.64□□□□□ -1.191e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-225ENST00000455545 539 ntTSL 37.61□□□□□ -1.191e-10■□□□□ 11.1
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SRSF9Q13242 IP6K2-204ENST00000412850 543 ntTSL 46.45□□□□□ -1.381e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 UBE2D2-208ENST00000511725 656 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.397e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 CA5A-203ENST00000568801 506 ntTSL 26.05□□□□□ -1.447e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-215ENST00000437427 576 ntTSL 45.6□□□□□ -1.511e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-217ENST00000443853 579 ntTSL 35.6□□□□□ -1.511e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 ASPSCR1-203ENST00000344865 1041 ntTSL 213.83□□□□□ -0.22e-25■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 ASPSCR1-209ENST00000581484 1001 ntTSL 210.66□□□□□ -0.72e-25■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 HGD-201ENST00000283871 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.385e-10■□□□□ 11
SRSF9Q13242 HGD-204ENST00000475447 565 ntTSL 35.33□□□□□ -1.565e-10■□□□□ 11
SRSF9Q13242 HGD-210ENST00000494453 683 ntTSL 35.33□□□□□ -1.565e-10■□□□□ 11
SRSF9Q13242 HGD-209ENST00000492108 631 ntTSL 24.7□□□□□ -1.665e-10■□□□□ 11
SRSF9Q13242 CHRD-216ENST00000486066 546 ntTSL 412□□□□□ -0.492e-9■□□□□ 11
SRSF9Q13242 CHRD-214ENST00000482805 608 ntTSL 410.23□□□□□ -0.772e-9■□□□□ 11
SRSF9Q13242 CHRD-210ENST00000461684 677 ntTSL 49.86□□□□□ -0.832e-9■□□□□ 11
SRSF9Q13242 CHRD-213ENST00000482014 560 ntTSL 49.76□□□□□ -0.852e-9■□□□□ 11
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SRSF9Q13242 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.491e-7■□□□□ 11
SRSF9Q13242 FTCD-212ENST00000498355 1936 ntTSL 218.1■□□□□ 0.491e-7■□□□□ 11
SRSF9Q13242 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.421e-7■□□□□ 11
SRSF9Q13242 LEMD2-202ENST00000421671 2323 ntTSL 316.35■□□□□ 0.211e-10■□□□□ 10.9
SRSF9Q13242 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.091e-10■□□□□ 10.9
SRSF9Q13242 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.161e-10■□□□□ 10.9
SRSF9Q13242 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.071e-6■□□□□ 10.9
SRSF9Q13242 DUXAP9-205ENST00000619938 642 ntTSL 1 (best)6.8□□□□□ -1.321e-6■□□□□ 10.9
SRSF9Q13242 DUXAP9-203ENST00000610585 903 ntTSL 36.72□□□□□ -1.331e-6■□□□□ 10.9
SRSF9Q13242 DUXAP9-207ENST00000621361 2397 ntTSL 1 (best)4.56□□□□□ -1.681e-6■□□□□ 10.9
SRSF9Q13242 PNN-204ENST00000554902 583 ntTSL 23.61□□□□□ -1.835e-15■□□□□ 10.9
SRSF9Q13242 PLEC-211ENST00000527303 598 ntTSL 313.54□□□□□ -0.244e-8■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.664e-8■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.674e-8■□□□□ 10.8
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SRSF9Q13242 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.784e-8■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.824e-8■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.844e-8■□□□□ 10.8
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SRSF9Q13242 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.854e-8■□□□□ 10.8
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SRSF9Q13242 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.224e-10■□□□□ 10.8
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SRSF9Q13242 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.224e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 FUS-206ENST00000487509 4920 ntTSL 212.19□□□□□ -0.464e-10■□□□□ 10.8
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SRSF9Q13242 SRSF5-219ENST00000557460 939 ntTSL 55.74□□□□□ -1.495e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 SRSF5-206ENST00000554021 567 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.65e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.65e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.592e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.762e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 RNF43-203ENST00000577716 4367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.952e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 RNF43-207ENST00000583753 3560 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.062e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 SNHG3-202ENST00000437681 2614 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.182e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 LAMA5-208ENST00000474128 579 ntTSL 310.73□□□□□ -0.697e-7■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.193e-19■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 PPM1G-202ENST00000472077 3752 ntTSL 26.86□□□□□ -1.313e-19■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.641e-6■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.711e-6■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 AP000347.1-205ENST00000451919 654 ntTSL 39.87□□□□□ -0.831e-6■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 AP000347.2-203ENST00000434893 403 ntTSL 29.36□□□□□ -0.911e-6■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 AP000347.1-203ENST00000438858 543 ntTSL 39.19□□□□□ -0.941e-6■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 AP000347.1-204ENST00000458554 438 ntTSL 38.74□□□□□ -1.011e-6■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 AP000347.2-201ENST00000423913 584 ntTSL 56.98□□□□□ -1.291e-6■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 EPS8L2-220ENST00000531393 2304 ntTSL 1 (best)14.59□□□□□ -0.071e-17■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 EPS8L2-212ENST00000528770 2233 ntTSL 213.58□□□□□ -0.241e-17■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.31e-17■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 EPS8L2-225ENST00000533816 540 ntTSL 512.34□□□□□ -0.431e-17■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 EPS8L2-202ENST00000524474 907 ntTSL 211.65□□□□□ -0.541e-17■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 EPS8L2-217ENST00000530452 704 ntTSL 311.4□□□□□ -0.581e-17■□□□□ 10.7
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