RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.35■■□□□ 1.49
RABGEF1-211ENST00000503687 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGEF1-211ENST00000503687 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.29■■□□□ 1.16
RABGEF1-211ENST00000503687 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RABGEF1-211ENST00000503687 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.14■□□□□ 0.98
RABGEF1-211ENST00000503687 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
RABGEF1-211ENST00000503687 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.66■□□□□ 0.9
RABGEF1-211ENST00000503687 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.57■□□□□ 0.88
RABGEF1-211ENST00000503687 TRIM41Q8WV44 630 aa20.41■□□□□ 0.86
RABGEF1-211ENST00000503687 ABCC9O60706 1549 aa20.4■□□□□ 0.86
RABGEF1-211ENST00000503687 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
RABGEF1-211ENST00000503687 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
RABGEF1-211ENST00000503687 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
RABGEF1-211ENST00000503687 HRCP23327 699 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.23■□□□□ 0.83
RABGEF1-211ENST00000503687 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RABGEF1-211ENST00000503687 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
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RABGEF1-211ENST00000503687 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.9■□□□□ 0.78
RABGEF1-211ENST00000503687 SCRIBQ14160 1630 aa19.86■□□□□ 0.77
RABGEF1-211ENST00000503687 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
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RABGEF1-211ENST00000503687 APLP2Q06481 763 aa19.66■□□□□ 0.74
RABGEF1-211ENST00000503687 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
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RABGEF1-211ENST00000503687 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
RABGEF1-211ENST00000503687 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
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RABGEF1-211ENST00000503687 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
RABGEF1-211ENST00000503687 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
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RABGEF1-211ENST00000503687 ITGAEP38570 1179 aa19.2■□□□□ 0.66
RABGEF1-211ENST00000503687 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.19■□□□□ 0.66
RABGEF1-211ENST00000503687 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
RABGEF1-211ENST00000503687 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.07■□□□□ 0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.05■□□□□ 0.64
RABGEF1-211ENST00000503687 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa18.86■□□□□ 0.61
RABGEF1-211ENST00000503687 WIZO95785 1651 aa18.86■□□□□ 0.61
RABGEF1-211ENST00000503687 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
RABGEF1-211ENST00000503687 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 NEUROD1Q13562 356 aa18.73■□□□□ 0.59
RABGEF1-211ENST00000503687 P3H3Q8IVL6 736 aa18.7■□□□□ 0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC88BA6NC98 1476 aa18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 SOGA1O94964 1423 aa18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 CEP162Q5TB80 1403 aa18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 ABCC8Q09428 1581 aa18.66■□□□□ 0.58
RABGEF1-211ENST00000503687 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
RABGEF1-211ENST00000503687 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.566e-6■■■□□ 16.7
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RABGEF1-211ENST00000503687 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
RABGEF1-211ENST00000503687 ARID3CA6NKF2 412 aa18.43■□□□□ 0.54
RABGEF1-211ENST00000503687 BCANQ96GW7 911 aa18.42■□□□□ 0.54
RABGEF1-211ENST00000503687 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa18.4■□□□□ 0.54
RABGEF1-211ENST00000503687 GOLGA3Q08378 1498 aa18.4■□□□□ 0.54
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RABGEF1-211ENST00000503687 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.38■□□□□ 0.53
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RABGEF1-211ENST00000503687 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
RABGEF1-211ENST00000503687 EEA1Q15075 1411 aa18.32■□□□□ 0.52
RABGEF1-211ENST00000503687 SMARCA2P51531 1590 aa18.29■□□□□ 0.52
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RABGEF1-211ENST00000503687 FBLN2P98095 1184 aa18.27■□□□□ 0.52
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RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
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RABGEF1-211ENST00000503687 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa17.96■□□□□ 0.47
RABGEF1-211ENST00000503687 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.96■□□□□ 0.47
RABGEF1-211ENST00000503687 CCNB3Q8WWL7 1395 aa17.94■□□□□ 0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 SYNJ1O43426 1573 aa17.94■□□□□ 0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 MTUS2Q5JR59 1369 aa17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 NCAPD3P42695 1498 aa17.91■□□□□ 0.46
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.91■□□□□ 0.46
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