Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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NPRL3Q12980 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
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NPRL3Q12980 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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NPRL3Q12980 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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NPRL3Q12980 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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NPRL3Q12980 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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NPRL3Q12980 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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NPRL3Q12980 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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NPRL3Q12980 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NPRL3Q12980 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
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NPRL3Q12980 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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NPRL3Q12980 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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NPRL3Q12980 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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NPRL3Q12980 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NPRL3Q12980 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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