Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHC1P78364 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHC1P78364 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHC1P78364 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHC1P78364 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHC1P78364 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PHC1P78364 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PHC1P78364 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHC1P78364 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHC1P78364 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PHC1P78364 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHC1P78364 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHC1P78364 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHC1P78364 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHC1P78364 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHC1P78364 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PHC1P78364 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHC1P78364 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHC1P78364 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHC1P78364 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHC1P78364 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHC1P78364 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHC1P78364 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHC1P78364 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHC1P78364 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHC1P78364 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHC1P78364 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHC1P78364 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHC1P78364 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHC1P78364 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHC1P78364 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHC1P78364 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PHC1P78364 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHC1P78364 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHC1P78364 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHC1P78364 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHC1P78364 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHC1P78364 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHC1P78364 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHC1P78364 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHC1P78364 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHC1P78364 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHC1P78364 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHC1P78364 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHC1P78364 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHC1P78364 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHC1P78364 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHC1P78364 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHC1P78364 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHC1P78364 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHC1P78364 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHC1P78364 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHC1P78364 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHC1P78364 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHC1P78364 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHC1P78364 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PHC1P78364 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHC1P78364 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PHC1P78364 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHC1P78364 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHC1P78364 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHC1P78364 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHC1P78364 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHC1P78364 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHC1P78364 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PHC1P78364 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHC1P78364 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHC1P78364 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHC1P78364 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PHC1P78364 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHC1P78364 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHC1P78364 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHC1P78364 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHC1P78364 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHC1P78364 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHC1P78364 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHC1P78364 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHC1P78364 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHC1P78364 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHC1P78364 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHC1P78364 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHC1P78364 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHC1P78364 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHC1P78364 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHC1P78364 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHC1P78364 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHC1P78364 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHC1P78364 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHC1P78364 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHC1P78364 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHC1P78364 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHC1P78364 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHC1P78364 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHC1P78364 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHC1P78364 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHC1P78364 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHC1P78364 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PHC1P78364 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHC1P78364 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHC1P78364 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms