Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB1P62873 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB1P62873 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB1P62873 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB1P62873 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB1P62873 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB1P62873 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB1P62873 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB1P62873 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB1P62873 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB1P62873 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB1P62873 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB1P62873 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB1P62873 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GNB1P62873 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB1P62873 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB1P62873 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB1P62873 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB1P62873 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB1P62873 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB1P62873 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB1P62873 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB1P62873 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB1P62873 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB1P62873 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB1P62873 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB1P62873 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB1P62873 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB1P62873 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GNB1P62873 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB1P62873 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB1P62873 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB1P62873 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB1P62873 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB1P62873 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB1P62873 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB1P62873 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB1P62873 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GNB1P62873 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GNB1P62873 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GNB1P62873 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB1P62873 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB1P62873 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB1P62873 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB1P62873 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB1P62873 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB1P62873 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB1P62873 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB1P62873 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB1P62873 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB1P62873 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB1P62873 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB1P62873 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB1P62873 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GNB1P62873 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB1P62873 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB1P62873 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB1P62873 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB1P62873 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB1P62873 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB1P62873 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB1P62873 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB1P62873 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB1P62873 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB1P62873 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB1P62873 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB1P62873 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB1P62873 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB1P62873 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GNB1P62873 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB1P62873 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB1P62873 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB1P62873 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB1P62873 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB1P62873 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB1P62873 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB1P62873 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB1P62873 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB1P62873 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GNB1P62873 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms