Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEC24CP53992 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEC24CP53992 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEC24CP53992 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms