Protein–RNA interactions for Protein: P53906

YNL146W, Uncharacterized protein YNL146W, yeast

Predictions only

Length 100 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL146W	P53906	HIS4	YCL030C	2400 nt		4.6	□□□□□ -1.67
YNL146W	P53906	STB2	YMR053C	2553 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YNL146W	P53906	GCV1	YDR019C	1203 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YNL146W	P53906	DPB4	YDR121W	591 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YNL146W	P53906	NUP42	YDR192C	1293 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YNL146W	P53906	OMS1	YDR316W	1416 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YNL146W	P53906	HXT7	YDR342C	1713 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YNL146W	P53906	HXT6	YDR343C	1713 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YNL146W	P53906	RMR1	YGL250W	726 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YNL146W	P53906	YHL049C	YHL049C	816 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YNL146W	P53906	GRE3	YHR104W	984 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YNL146W	P53906	LOH1	YJL038C	660 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YNL146W	P53906	YML031C-A	YML031C-A	336 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YNL146W	P53906	YML119W	YML119W	1074 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YNL146W	P53906	KCC4	YCL024W	3114 nt		4.59	□□□□□ -1.67
YNL146W	P53906	KIN2	YLR096W	3444 nt		4.59	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	EAR1	YMR171C	1653 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	MDR1	YGR100W	2853 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	YFT2	YDR319C	825 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	YEL045C	YEL045C	426 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	snR19	snR19	568 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	PAH1	YMR165C	2589 nt		4.58	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	YBR139W	YBR139W	1527 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	GWT1	YJL091C	1473 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	DXO1	YDR370C	1329 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	PER1	YCR044C	1074 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	snR7-S	snR7-S	179 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	YDR445C	YDR445C	408 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	YEL028W	YEL028W	462 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	BUD25	YER014C-A	462 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	tK(CUU)C	tK(CUU)C	73 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	tK(CUU)D1	tK(CUU)D1	73 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	tK(CUU)D2	tK(CUU)D2	73 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	tK(CUU)E1	tK(CUU)E1	73 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	tK(CUU)E2	tK(CUU)E2	73 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	tK(CUU)F	tK(CUU)F	73 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	tK(CUU)G1	tK(CUU)G1	73 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	tK(CUU)G2	tK(CUU)G2	73 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	tK(CUU)G3	tK(CUU)G3	73 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	YER133W-A	YER133W-A	342 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	tK(CUU)I	tK(CUU)I	73 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	tK(CUU)J	tK(CUU)J	73 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	tK(CUU)K	tK(CUU)K	73 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	tK(CUU)M	tK(CUU)M	73 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	tK(CUU)P	tK(CUU)P	73 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	YLR407W	YLR407W	687 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	YOL079W	YOL079W	399 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	GSM1	YJL103C	1857 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	TIP20	YGL145W	2106 nt		4.57	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	IMA3	YIL172C	1770 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	IMA4	YJL221C	1770 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	YDL183C	YDL183C	963 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	UBC1	YDR177W	648 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	YMR082C	YMR082C	357 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	MRP21	YBL090W	534 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	YBR196C-B	YBR196C-B	105 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	TIF4632	YGL049C	2745 nt		4.56	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	MDM30	YLR368W	1797 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	TRM11	YOL124C	1302 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	UIP3	YAR027W	708 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	YBL029W	YBL029W	1131 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	VPS68	YOL129W	555 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	YOR131C	YOR131C	657 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	ARC40	YBR234C	1155 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	PMT5	YDL093W	2232 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	PRP28	YDR243C	1767 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	BOP2	YLR267W	1713 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	RAD52	YML032C	1416 nt		4.55	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	HOS2	YGL194C	1359 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	SSA2	YLL024C	1920 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	PFK1	YGR240C	2964 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	TRE1	YPL176C	2352 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	RPC53	YDL150W	1269 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	CDC42	YLR229C	576 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	MRPL3	YMR024W	1173 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	YMR147W	YMR147W	672 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	YPR150W	YPR150W	522 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	IZH3	YLR023C	1632 nt		4.54	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	SSB1	YDL229W	1842 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	MNN1	YER001W	2289 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	FLC1	YPL221W	2382 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	MSK1	YNL073W	1731 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	YDL228C	YDL228C	642 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	INO2	YDR123C	915 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	SPO12	YHR152W	522 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	GPP1	YIL053W	753 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	EFB1	YAL003W	621 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	TVP38	YKR088C	1014 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	YLR036C	YLR036C	612 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	RPS0B	YLR048W	759 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	AST1	YBL069W	1290 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	ARR1	YPR199C	885 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	MUM3	YOR298W	1440 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	NUP2	YLR335W	2163 nt		4.53	□□□□□ -1.68
YNL146W	P53906	ARG4	YHR018C	1392 nt		4.53	□□□□□ -1.69
YNL146W	P53906	PGM2	YMR105C	1710 nt		4.52	□□□□□ -1.69
YNL146W	P53906	AVT1	YJR001W	1809 nt		4.52	□□□□□ -1.69
YNL146W	P53906	IMG2	YCR071C	441 nt		4.52	□□□□□ -1.69
YNL146W	P53906	BUD13	YGL174W	801 nt		4.52	□□□□□ -1.69
YNL146W	P53906	MIC26	YGR235C	702 nt		4.52	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 131.9 ms