Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP11P51784 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP11P51784 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP11P51784 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP11P51784 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP11P51784 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP11P51784 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP11P51784 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP11P51784 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP11P51784 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP11P51784 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP11P51784 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP11P51784 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP11P51784 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP11P51784 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP11P51784 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP11P51784 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP11P51784 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP11P51784 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP11P51784 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP11P51784 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP11P51784 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP11P51784 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP11P51784 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP11P51784 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP11P51784 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP11P51784 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP11P51784 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP11P51784 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP11P51784 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP11P51784 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP11P51784 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP11P51784 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
USP11P51784 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
USP11P51784 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP11P51784 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP11P51784 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP11P51784 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP11P51784 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP11P51784 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP11P51784 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP11P51784 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP11P51784 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP11P51784 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP11P51784 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP11P51784 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP11P51784 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP11P51784 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP11P51784 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP11P51784 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP11P51784 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP11P51784 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP11P51784 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP11P51784 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP11P51784 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP11P51784 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP11P51784 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP11P51784 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP11P51784 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP11P51784 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP11P51784 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP11P51784 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP11P51784 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP11P51784 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP11P51784 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP11P51784 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP11P51784 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP11P51784 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP11P51784 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP11P51784 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP11P51784 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP11P51784 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP11P51784 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP11P51784 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP11P51784 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP11P51784 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP11P51784 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP11P51784 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP11P51784 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
USP11P51784 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms