Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKN2BP42772 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKN2BP42772 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKN2BP42772 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms