Protein–RNA interactions for Protein: P40426

PBX3, Pre-B-cell leukemia transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX3P40426 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX3P40426 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX3P40426 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX3P40426 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX3P40426 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PBX3P40426 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX3P40426 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX3P40426 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX3P40426 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX3P40426 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX3P40426 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX3P40426 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX3P40426 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX3P40426 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX3P40426 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX3P40426 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX3P40426 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX3P40426 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX3P40426 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX3P40426 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX3P40426 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PBX3P40426 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX3P40426 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX3P40426 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX3P40426 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX3P40426 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX3P40426 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX3P40426 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX3P40426 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX3P40426 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX3P40426 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX3P40426 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX3P40426 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX3P40426 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PBX3P40426 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PBX3P40426 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PBX3P40426 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PBX3P40426 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX3P40426 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX3P40426 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX3P40426 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX3P40426 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX3P40426 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX3P40426 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX3P40426 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX3P40426 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX3P40426 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PBX3P40426 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX3P40426 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX3P40426 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX3P40426 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX3P40426 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX3P40426 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX3P40426 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX3P40426 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX3P40426 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX3P40426 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX3P40426 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX3P40426 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX3P40426 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX3P40426 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX3P40426 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX3P40426 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PBX3P40426 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX3P40426 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX3P40426 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX3P40426 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX3P40426 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX3P40426 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX3P40426 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX3P40426 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX3P40426 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX3P40426 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX3P40426 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX3P40426 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX3P40426 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX3P40426 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PBX3P40426 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX3P40426 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX3P40426 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX3P40426 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX3P40426 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX3P40426 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PBX3P40426 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX3P40426 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX3P40426 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX3P40426 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX3P40426 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX3P40426 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX3P40426 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PBX3P40426 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX3P40426 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX3P40426 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX3P40426 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX3P40426 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX3P40426 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX3P40426 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX3P40426 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX3P40426 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PBX3P40426 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms